通风柜的作用是排出实验中产生的有毒有害气体，以保护实验人员的安全，因此是一种空气净化设备，而超净工作台也是实验用净化设备的一种，虽然同为净化设备，但二者作用不同，因此互相之间不可替代。
通风柜俗称通风厨，看字面意思就知道是用来通风排气的，但与普通的排气设备不同，通风柜能够将有害气体控制在柜体内，然后排出，因此在排出气体的同时，还能保护人员不受有害气体的伤害，但其作用只局限于通风排气，对于清除微生物介质的作用就没有那么的明显了。
而超净工作台能够通过控制垂直或者平流风，防止柜体内的实验品受到外界的污染，径直吹过的风流如同隔离层，将粉尘、细菌污染等因素隔离在风流层之外，但它的缺点也很明显，通风柜将污染物吸入排出能够保护实验人员，而超净工作台只是控制风流，因此无法将有害气体排出，在进行工作时，垂直或者平流的风流会将细菌等有害气体吹向工作人员，因此使用时一定要做好防护措施。
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