洁净实验室分为多种，这是因为不同的行业对洁净实验室的定义不同，工业洁净室多要求粉尘洁净度，而生物洁净室，则对微生物细菌的控制十分严格，因此洁净实验室并不是指单一的实验室种类。
工业洁净室的清洁目标是粉尘、灰尘等工业污染，因此要保证环境内尘土微粒对实验的影响，因为粉尘灰尘本身带有静电，而工业洁净室是进行工业实验的空间，如粉尘过多，环境内就会充斥静电，进而引发设备数据不准，或者导致仪器损坏等现象，同时室内的干湿度，也是会对工业实验造成较大影响的因素。
生物洁净室是进行微生物实验的空间，生物洁净室对环境的清洁度要求比前者更高，除了要求环境内粉尘污染的指数，还要求环境内微生物以及细菌的清洁度，因为一旦进行微生物实验，那么外界的细菌等就会直接影响，造成实验数据的不准确，而我们需要做的就是，对生物洁净室进行各种灭菌处理，同时定期进行检测，确保实验室内部微生物含量的指数，使生物洁净室一直处于足够洁净的条件。
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